prep_norm_microarray: Preprocesamiento y Normalización de datos de microarrays

In jrufv/TFMjrufv: Framework para el análisis de datos ómicos

Description

Realiza el preprocesamiento y la normalización de datos de microarrays almacenados en objetos del tipo ExpressionFeatureSet.

Usage

prep_norm_microarray(
  object,
  varFilter = TRUE,
  featureFilter = TRUE,
  annot_pack = NULL,
  ...
)

Arguments

object	Objeto del tipo ExpressionFeatureSet.
varFilter, featureFilter	Lógico, si es TRUE se aplicará el filtrado por varianza (varFilter), o el filtrado basado en anotaciones y la eliminación de duplicados (featureFilter). Si ambos son TRUE se aplican ambos filtrados.
annot_pack	Paquete de anotaciones (para datos de microarrays).
...	Más argumentos que se pasan a rma o nsFilter.

Value

Un objeto de la clase ExpressionSet que contiene los datos resultantes del preprocesamiento aplicado

Examples

norm_data_microarray <- prep_norm_microarray(data_microarray,
                                             varFilter = TRUE,
                                             featureFilter = TRUE,
                                             annot_pack = "hgu133a.db")
norm_data_microarray

jrufv/TFMjrufv documentation built on Dec. 21, 2021, 3:15 a.m.