prep_norm_rna: Preprocesamiento y Normalización de datos de RNA-Seq

In jrufv/TFMjrufv: Framework para el análisis de datos ómicos

Description

Realiza el preprocesamiento y la normalización de datos de RNA-Seq almacenados en objetos del tipo DGEList.

Usage

prep_norm_rna(object, usFilter = TRUE, ...)

Arguments

object	Objeto del tipo DGEList.
usFilter	Lógico, si es TRUE se aplicará un filtrado no específico eliminando filas para las que la mitad de las muestras tengan un recuento por millón menor a 1.
...	Más argumentos que se pasan a calcNormFactors

Value

Un objeto de la clase DGEList que contiene los datos resultantes del preprocesamiento aplicado

Examples

norm_data_RNASeq <- prep_norm_rna(data_RNASeq, usFilter = TRUE,
                                  method = "TMM")
norm_data_RNASeq

jrufv/TFMjrufv documentation built on Dec. 21, 2021, 3:15 a.m.