R/nkbc-kir-onkoplastik-69.R

In oc1lojo/nkbcind: Verktyg för kvalitetsindikatorer och populationskarakteristik från NKBC

#' @export
nkbc69 <- list(
  code = "nkbc69",
  kortnamn = "nkbc_kir_onkoplastik_69",
  lab = c(
    sv = "Onkoplastikkirurgi"
  ),
  lab_short_w_pop = c(
    sv = "Onkoplastikkirurgi vid partiell mastektomi"
  ),
  pop = c(
    sv = "fall opererade med partiell mastektomi utan fjärrmetastaser vid diagnos"
  ),
  filter_pop = function(x, ...) {
    dplyr::filter(
      x,
      # Uppgifter började registreras hösten 2017
      lubridate::year(a_diag_dat) >= 2018,

      # Enbart opererade fall
      !is.na(op_kir_dat),

      # Enbart fall med partiell mastektomi
      op_kir_brost_Varde == 1,

      # Ej fall med fjärrmetastaser vid diagnos
      !(a_tnm_mklass_Varde %in% 10)
    )
  },
  mutate_outcome = function(x, ...) {
    dplyr::mutate(x,
      outcome = dplyr::case_when(
        op_kir_onkoplastik_Varde == 0L ~ FALSE,
        op_kir_onkoplastik_Varde == 1L ~ TRUE,
        op_kir_onkoplastik_Varde == 98L ~ NA
      )
    )
  },
  sjhkod_var = "op_inr_sjhkod",
  other_vars = "a_pat_alder",
  om_indikatorn = NULL,
  vid_tolkning = NULL,
  teknisk_beskrivning = NULL
)
class(nkbc69) <- "nkbcind"