# global variables.
.CF.GV <- list(
amino.acid = c("A", "C", "D", "E", "F", "G", "H", "I", "K", "L",
"M", "N", "P", "Q", "R", "S", "T", "V", "W", "X", "Y"),
amino.acid.3 = c("Ala", "Cys", "Asp", "Glu", "Phe", "Gly", "His",
"Ile", "Lys", "Leu", "Met", "Asn", "Pro", "Gln",
"Arg", "Ser", "Thr", "Val", "Trp", "Stop", "Tyr"),
synonymous.codon = list(
A = c("GCA", "GCC", "GCG", "GCT"),
C = c("TGC", "TGT"),
D = c("GAC", "GAT"),
E = c("GAA", "GAG"),
F = c("TTC", "TTT"),
G = c("GGA", "GGC", "GGG", "GGT"),
H = c("CAC", "CAT"),
I = c("ATA", "ATC", "ATT"),
K = c("AAA", "AAG"),
L = c("CTA", "CTC", "CTG", "CTT", "TTA", "TTG"),
M = c("ATG"),
N = c("AAC", "AAT"),
P = c("CCA", "CCC", "CCG", "CCT"),
Q = c("CAA", "CAG"),
R = c("AGA", "AGG", "CGA", "CGC", "CGG", "CGT"),
S = c("AGC", "AGT", "TCA", "TCC", "TCG", "TCT"),
T = c("ACA", "ACC", "ACG", "ACT"),
V = c("GTA", "GTC", "GTG", "GTT"),
W = c("TGG"),
X = c("TAA", "TAG", "TGA"),
Y = c("TAC", "TAT")
),
amino.acid.split = c("A", "C", "D", "E", "F", "G", "H", "I", "K", "L",
"M", "N", "P", "Q", "R", "S", "T", "V", "W", "X", "Y",
"Z"),
amino.acid.split.3 = c("Ala", "Cys", "Asp", "Glu", "Phe", "Gly", "His",
"Ile", "Lys", "Leu", "Met", "Asn", "Pro", "Gln",
"Arg", "Ser4", "Thr", "Val", "Trp", "Stop", "Tyr",
"Ser2"),
synonymous.codon.split = list(
A = c("GCA", "GCC", "GCG", "GCT"),
C = c("TGC", "TGT"),
D = c("GAC", "GAT"),
E = c("GAA", "GAG"),
F = c("TTC", "TTT"),
G = c("GGA", "GGC", "GGG", "GGT"),
H = c("CAC", "CAT"),
I = c("ATA", "ATC", "ATT"),
K = c("AAA", "AAG"),
L = c("CTA", "CTC", "CTG", "CTT", "TTA", "TTG"),
M = c("ATG"),
N = c("AAC", "AAT"),
P = c("CCA", "CCC", "CCG", "CCT"),
Q = c("CAA", "CAG"),
R = c("AGA", "AGG", "CGA", "CGC", "CGG", "CGT"),
S = c("TCA", "TCC", "TCG", "TCT"), # split 2 codons to Z.
T = c("ACA", "ACC", "ACG", "ACT"),
V = c("GTA", "GTC", "GTG", "GTT"),
W = c("TGG"),
X = c("TAA", "TAG", "TGA"), # stop codons.
Y = c("TAC", "TAT"),
Z = c("AGC", "AGT") # obtain 2 codons from S.
)
) # End of .CF.GV.
Add the following code to your website.
For more information on customizing the embed code, read Embedding Snippets.