Files in Biogen-Inc/tidyCDISC
Quick Table Generation & Exploratory Analyses on ADaM-Ish Datasets

.Rbuildignore
.Rprofile
.github/.gitignore
.github/workflows/R-CMD-check-devel.yaml
.github/workflows/R-CMD-check-master.yaml
.github/workflows/pkgdown.yaml
.github/workflows/test-coverage.yaml
.gitignore
CODE_OF_CONDUCT.md
DESCRIPTION
IDEA.Rproj
LICENSE.md
NAMESPACE
NEWS.md R/_disable_autoload.R R/app_config.R R/app_server.R R/app_ui.R R/data-example.R R/data-phuse_TDF_ADaM.R R/global.R R/golem_utils_server.R R/golem_utils_ui.R R/mod_dataComply.R R/mod_dataComplyRules.R R/mod_dataComplyRules_fct_helpers.R R/mod_dataComply_fct_helpers.R R/mod_dataUpload.R R/mod_indvExpPat.R R/mod_indvExpPatEvents.R R/mod_indvExpPatVisits.R R/mod_indvExpPatVisits_fct_plot.R R/mod_indvExp_fct_buildEvents.R R/mod_indvExp_fct_organizeEvent.R R/mod_indvExp_srv.R R/mod_indvExp_ui.R R/mod_indvExp_utils_helpers.R R/mod_popExp.R R/mod_popExp_boxplot.R R/mod_popExp_fct_boxplot.R R/mod_popExp_fct_heatCorr.R R/mod_popExp_fct_km.R R/mod_popExp_fct_line.R R/mod_popExp_fct_scatterplot.R R/mod_popExp_fct_spaghettiplot.R R/mod_popExp_heatCorr.R R/mod_popExp_km.R R/mod_popExp_line.R R/mod_popExp_scatter.R R/mod_popExp_spaghetti.R R/mod_popExp_ui.R R/mod_popExp_utils.R R/mod_selectData.R R/mod_tableGen.R R/mod_tableGen_fct_anova.R R/mod_tableGen_fct_blocks.R R/mod_tableGen_fct_chg.R R/mod_tableGen_fct_freq.R R/mod_tableGen_fct_max_freq.R R/mod_tableGen_fct_mean.R R/mod_tableGen_fct_meanSummary.R R/mod_tableGen_fct_methods.R R/mod_tableGen_fct_nested_freq.R R/mod_tableGen_fct_non_missing.R R/mod_tableGen_fct_y.R R/mod_tableGen_ui.R R/mod_tableGen_utils.R R/run_app.R
R/sysdata.rda
R/utils-pipe.R R/utils_SAScompare.R R/utils_helpers.R R/utils_strObjs.R README.Rmd README.md
_pkgdown.yml
app.R cran-comments.md data-raw/adae.R
data-raw/adae.xpt
data-raw/adlbc.R
data-raw/adlbc.xpt
data-raw/adsl.R
data-raw/adsl.xpt
data-raw/adtte.R
data-raw/adtte.xpt
data-raw/advs.R
data-raw/advs.xpt
data-raw/examples_data.R data-raw/internal-data.R
data/adae.rda
data/adlbc.rda
data/adsl.rda
data/adtte.rda
data/advs.rda
data/example_dat1.rda
data/example_dat2.rda
dev/01_start.R dev/02_dev.R dev/03_deploy.R dev/run_dev.R
inst/WORDLIST
inst/app/www/accordian.js
inst/app/www/app_FAVICON.ico
inst/app/www/app_ICON.png
inst/app/www/batchDownload_html.Rmd inst/app/www/batchDownload_pdf.Rmd
inst/app/www/email.svg
inst/app/www/favicon.ico
inst/app/www/github.png
inst/app/www/hex-tidyCDISC.png
inst/app/www/logo.svg
inst/app/www/recipe.js
inst/app/www/red_x.png
inst/app/www/script.js
inst/app/www/styles.css
inst/app/www/sync_divs.js
inst/app/www/timevis.css
inst/app/www/timevis.sass
inst/app/www/yeti.css
inst/golem-config.yml
man/adae.Rd man/adlbc.Rd man/adsl.Rd man/adtte.Rd man/advs.Rd man/app_methods.Rd man/col_for_list_expr.Rd man/common_rownames.Rd man/data_to_filter.Rd man/data_to_use_str.Rd man/example_dat1.Rd man/example_dat2.Rd
man/figures/app_ICON.png
man/figures/blog-word-cloud.jpg
man/figures/demo_tidyCDISC_button_lite2dark.png
man/figures/hex-tidyCDISC-170h.png
man/figures/hex-tidyCDISC.png
man/figures/news.png
man/figures/pct_95.jpg
man/figures/pct_95_cropped.jpg
man/figures/tidyCDISC_RMedicine_thumbnail.png
man/figures/youtube.png
man/get_levels.Rd man/prep_adae.Rd man/prep_adsl.Rd man/prep_bds.Rd man/pretty_IDs.Rd man/run_app.Rd man/std_footnote.Rd man/tg_gt.Rd man/varN_fctr_reorder.Rd
renv.lock
renv/.gitignore
renv/activate.R
renv/settings.dcf
revdep/.gitignore
revdep/email.yml
scripts/os-health.R scripts/riskmetric.R tests/spelling.R tests/testthat.R tests/testthat/Rplots.pdf tests/testthat/test-mod_dataComplyRules_fct_helpers.R tests/testthat/test-mod_dataComply_fct_helpers.R tests/testthat/test-mod_indvExpPatVisits_fct_plot.R tests/testthat/test-mod_indvExp_fct_buildEvents.R tests/testthat/test-mod_tableGen_fct_anova.R tests/testthat/test-mod_tableGen_fct_chg.R tests/testthat/test-popExp_fct_boxplot.R tests/testthat/test-popExp_fct_scatterplot.R tests/testthat/test-popExp_fct_spaghettiplot.R tests/testthat/test-tableGen_fct_blocks.R tests/testthat/test-tableGen_fct_freq.R tests/testthat/test-tableGen_fct_max_freq.R tests/testthat/test-tableGen_fct_mean.R tests/testthat/test-tableGen_fct_methods.R tests/testthat/test-tableGen_fct_nested_freq.R tests/testthat/test-tableGen_fct_non_missing.R tests/testthat/test-tableGen_fct_y_freq.R
vignettes/.gitignore
vignettes/Blog.Rmd vignettes/announcing-tidycdisc-0-0-1-1.Rmd vignettes/announcing-tidycdisc-0-2-1.Rmd
vignettes/cran_figures/02-TG-tidyCDISC.PNG
vignettes/cran_figures/03-age_mean.PNG
vignettes/cran_figures/04-diabp_mean.PNG
vignettes/cran_figures/TG_STAN_dropdown.PNG
vignettes/cran_figures/TG_need_help.PNG
vignettes/cran_figures/bins.PNG
vignettes/cran_figures/demo_tidyCDISC_button_lite2dark.png
vignettes/cran_figures/download_report.PNG
vignettes/cran_figures/drill_down_events.PNG
vignettes/cran_figures/drill_down_visits.PNG
vignettes/cran_figures/external-link-alt.PNG
vignettes/cran_figures/filter_patients.PNG
vignettes/cran_figures/landing_page_tidyCDISC.PNG
vignettes/cran_figures/line_plot_mean_over_time_breakdown.PNG
vignettes/cran_figures/line_plot_mean_over_time_tidyCDISC.PNG
vignettes/cran_figures/quick_upload_then_tg_tidyCDISC.PNG
vignettes/cran_figures/quick_upload_then_tg_tidyCDISC_red.PNG
vignettes/cran_figures/t_disp.PNG
vignettes/cran_figures/t_disp_red.PNG
vignettes/dev01_Table_Gen.Rmd vignettes/dev02_Pop_Exp.Rmd vignettes/dev03_Indv_Expl.Rmd
vignettes/figures/IndvExp/01_dataUpload.PNG
vignettes/figures/IndvExp/02_start.PNG
vignettes/figures/IndvExp/03_adv_filt.PNG
vignettes/figures/IndvExp/04_adv_filt_2_dfs.PNG
vignettes/figures/IndvExp/05_adv_filt_2_dfs_abs.PNG
vignettes/figures/IndvExp/06_adv_filt_2_dfs_age.PNG
vignettes/figures/IndvExp/07_selPatNo.PNG
vignettes/figures/IndvExp/08_events_sel.PNG
vignettes/figures/IndvExp/09_events_all.PNG
vignettes/figures/IndvExp/10_events_applyFilters.PNG
vignettes/figures/IndvExp/11_events_datatable.PNG
vignettes/figures/IndvExp/11_visits_default.PNG
vignettes/figures/IndvExp/12_visits_default.PNG
vignettes/figures/IndvExp/13_visits_sel_adam.PNG
vignettes/figures/IndvExp/14_visits_sel_paramcd.PNG
vignettes/figures/IndvExp/15_visits_sel_visit.PNG
vignettes/figures/IndvExp/16_visits_sel_overlay.PNG
vignettes/figures/IndvExp/16_visits_sel_overlay_hor.PNG
vignettes/figures/IndvExp/16_visits_sel_overlay_hor_graph.PNG
vignettes/figures/IndvExp/17_visits_sel_overlay_events.PNG
vignettes/figures/IndvExp/18_visits_sel_overlay_events_graph.PNG
vignettes/figures/IndvExp/19_visits_sel_overlay_events_prefilters.PNG
vignettes/figures/IndvExp/20_visits_sel_overlay_events_prefilters_graph.PNG
vignettes/figures/IndvExp/21_visits_sel_overlay_events_manfilt.PNG
vignettes/figures/IndvExp/22_visits_sel_overlay_events_manfilt_plot.PNG
vignettes/figures/IndvExp/23_visits_datatable.PNG
vignettes/figures/IndvExp/24_bd.PNG
vignettes/figures/IndvExp/25_bd_report.PNG
vignettes/figures/IndvExp/Events_Plot_Interactivity.gif
vignettes/figures/IndvExp/Visits_Plot_Interactivity.gif
vignettes/figures/IndvExp/drill_down_events.gif
vignettes/figures/IndvExp/drill_down_visits.gif
vignettes/figures/IndvExp/filter_patients.gif
vignettes/figures/IndvExp/org_df_events_output.PNG
vignettes/figures/IndvExp/q.PNG
vignettes/figures/blog-0-2-1/atpt_dropdown.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/atpt_output.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/hlines_gone.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/hlines_present.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/rtf_output.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/rtf_output_download_table_arrow.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/select_all.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/select_all_output.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/studyid_w_arrow.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/table41_all.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/table_footnote_field_arrow.png
vignettes/figures/blog-0-2-1/table_footnote_output_arrow.png
vignettes/figures/blog/demo_tidyCDISC_button_lite2dark_aura_cropped.png
vignettes/figures/blog/important_announcement.jpg
vignettes/figures/blog/important_announcement_cropped.jpg
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_dark2lite.png
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_dark2lite_aura.PNG
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_lite2dark.png
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_lite2dark_aura.PNG
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_lite2dark_aura_cropped.png
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_solid_blue.png
vignettes/figures/demo_tidyCDISC_button_solid_blue_aura.PNG
vignettes/figures/filter/filter_adsl_dbl_chr_fct.PNG
vignettes/figures/filter/filter_button.PNG
vignettes/figures/filter/filter_dbl.PNG
vignettes/figures/filter/filter_dbl_chr_fct.PNG
vignettes/figures/filter/filter_no_NAs_change_date.gif
vignettes/figures/filter/filter_reorder_and_del.gif
vignettes/figures/filter/filter_search.PNG
vignettes/figures/filter/filtering_date.PNG
vignettes/figures/filter/filtering_date_rows_reduced.PNG
vignettes/figures/filter/find_button_indvExp.gif
vignettes/figures/filter/find_button_popex.gif
vignettes/figures/filter/find_button_popex_OG.gif
vignettes/figures/filter/find_button_tg.gif
vignettes/figures/filter/popEx_Filtering_text.PNG
vignettes/figures/filter/select_multi_data.PNG
vignettes/figures/overlay_tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/overlay_tidyCDISC_noBulb.PNG
vignettes/figures/popExp/Boxplot.png
vignettes/figures/popExp/apply_filters_toggle.gif
vignettes/figures/popExp/basic_plot.PNG
vignettes/figures/popExp/box_add_points.PNG
vignettes/figures/popExp/box_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/box_plot.PNG
vignettes/figures/popExp/box_plot_add_points.PNG
vignettes/figures/popExp/box_plot_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/boxplot_tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/popExp/color_by.PNG
vignettes/figures/popExp/color_by_and_group_by.PNG
vignettes/figures/popExp/create_plot.png
vignettes/figures/popExp/download_data.PNG
vignettes/figures/popExp/filtering_widget.PNG
vignettes/figures/popExp/general_param_setup.PNG
vignettes/figures/popExp/general_var_setup.PNG
vignettes/figures/popExp/geom_histogram.png
vignettes/figures/popExp/group_by.PNG
vignettes/figures/popExp/group_data.PNG
vignettes/figures/popExp/heatmap.PNG
vignettes/figures/popExp/heatmap_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/heatmap_controls_grouped.PNG
vignettes/figures/popExp/heatmap_data.PNG
vignettes/figures/popExp/heatmap_grouped.PNG
vignettes/figures/popExp/interactivity.gif
vignettes/figures/popExp/km.PNG
vignettes/figures/popExp/km_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/km_controls_grouped.PNG
vignettes/figures/popExp/km_grouped.PNG
vignettes/figures/popExp/layout.PNG
vignettes/figures/popExp/layout_tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/popExp/line_plot.PNG
vignettes/figures/popExp/line_plot_95_ci.PNG
vignettes/figures/popExp/line_plot_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/line_plot_data.PNG
vignettes/figures/popExp/line_plot_mean_over_time.gif
vignettes/figures/popExp/line_plot_mean_over_time_breakdown.gif
vignettes/figures/popExp/line_plot_mean_over_time_tidyCDISC.gif
vignettes/figures/popExp/line_plot_option_chng.PNG
vignettes/figures/popExp/need_help.gif
vignettes/figures/popExp/scatter_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/scatter_outlier.PNG
vignettes/figures/popExp/spaghetti_controls.PNG
vignettes/figures/popExp/spaghetti_plot.PNG
vignettes/figures/popExp/tutorial_data.PNG
vignettes/figures/popExp/type_of_chart.PNG
vignettes/figures/tableGen/02-TG-tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/tableGen/02-TG.png
vignettes/figures/tableGen/03-age_mean.gif
vignettes/figures/tableGen/04-diabp_mean.gif
vignettes/figures/tableGen/TG_Anova.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_Anova_dd.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_CHG.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_MAX_FREQ.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_NON_MISSING.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_Nested_Freq.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_Nested_Freq2.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_STAN_TAB41.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_STAN_TAB41_DD.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_STAN_dropdown.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_Y_FREQ.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_export_table.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_filtering.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_need_help.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_need_help_guide_demo.gif
vignettes/figures/tableGen/TG_reproduce_code.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_reproduce_code_tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/tableGen/TG_reprpoduce_button.PNG
vignettes/figures/tableGen/add_freq_reshuffle_delete.gif
vignettes/figures/tableGen/bins.gif
vignettes/figures/tableGen/grouped_by.PNG
vignettes/figures/tableGen/grouping.gif
vignettes/figures/tableGen/new_release_stat_blocks.PNG
vignettes/figures/tableGen/quick_upload_then_tg.gif
vignettes/figures/tableGen/quick_upload_then_tg_tidyCDISC.gif
vignettes/figures/tableGen/t_disp.gif
vignettes/figures/tableGen/title_download.gif
vignettes/figures/upldDat/browse.PNG
vignettes/figures/upldDat/cdisc_pilot_button.PNG
vignettes/figures/upldDat/error.PNG
vignettes/figures/upldDat/landing_page.PNG
vignettes/figures/upldDat/landing_page_tidyCDISC.PNG
vignettes/figures/upldDat/upload_rules.PNG
vignettes/figures/upldDat/use_and_browse_pilot_data.gif
vignettes/figures/upldDat/use_and_browse_pilot_data_tidyCDISC.gif
vignettes/getting_started.Rmd vignettes/tidyCDISC.Rmd vignettes/x00_Data_Upload.Rmd vignettes/x01_Table_Generator.Rmd vignettes/x02_Pop_Exp.Rmd vignettes/x03_Indv_Expl.Rmd vignettes/x04_Filtering.Rmd
Biogen-Inc/tidyCDISC documentation built on April 22, 2023, 2:12 p.m.