validatie.afgeleid: Validatie van het afgeleid model

In inbo/dhcurve: Automated Modelling of Diameter Height Curves for Trees

Validatie van het afgeleid model

Description

Functie die de validatie uitvoert op het verschoven Vlaams model en een overzicht geeft van de afwijkende metingen (zodat de gebruiker deze kan valideren).

validatie.afgeleid() roept meerdere hulpfuncties op:

• rmse.basis() en rmse.verschuiving()

• afwijkendeMetingen()

• validatierapport()

Voorafgaand aan het uitvoeren van deze laatste functie worden eerst de slechtste modellen opgelijst (op basis van RMSE en afwijkende metingen).

Usage

validatie.afgeleid(
  Basismodel,
  Afgeleidmodel,
  AantalDomHogeRMSE = 20,
  ExtraCurvesRapport = NULL,
  Bestandsnaam = "Validatie_Afgeleid.html",
  TypeRapport = "Dynamisch",
  PathWD = getwd()
)

Arguments

Basismodel	Model per boomsoort zoals teruggegeven door de functie fit.basis(): tibble met de velden BMS (boomsoort) en Model (lme-object met het gefit mixed model voor die boomsoort)
Afgeleidmodel	Model per boomsoort-domeincombinatie zoals teruggegeven door de functie fit.afgeleid(): list met 2 tibbles.
AantalDomHogeRMSE	Standaard worden de 20 domeinen met de hoogste RMSE geselecteerd en voor elk van deze domeinen worden minstens 10 afwijkende metingen geselecteerd. AantalDomHogeRMSE laat toe om dit aantal van 20 domeinen aan te passen.
ExtraCurvesRapport	Optie om een lijst met extra boomsoort-domeincombinaties op te geven waardoor de curve getoond moet worden in het validatierapport. Deze moeten opgegeven worden als een dataframe met velden DOMEIN_ID en BMS, met benamingen die overeenkomen met deze in de opgegeven dataset.
Bestandsnaam	Een naam voor het validatierapport (.html-bestand) dat gegenereerd wordt, bestaande uit een string die eindigt op .html
TypeRapport	Default is "Dynamisch", waarbij de figuren in het .html-bestand kunnen worden aangepast (meetgegevens weergeven door muis erover te bewegen (inclusief ID als deze in de dataset meegegeven is), items uit legende wegklikken, grafiek inzoomen,...). Een andere optie is "Statisch", waarbij de figuren vast zijn.
PathWD	Het path van de working directory, dus het path waarin het validatierapport opgeslagen moet worden (default wordt het in de op dat moment actieve working directory opgeslagen).

Value

De functie genereert een validatierapport (.html-bestand) in de working directory met informatie en grafieken van de te controleren metingen. De afwijkende metingen zijn in rood aangeduid (zie ?validatierapport of vignet voor meer informatie).

De functie geeft een dataframe terug met de te controleren metingen, met behalve de informatie uit de databank een aantal berekende waarden:

• H_D_finaal: een geschatte hoogte voor de omtrekklasse volgens het domeinmodel

• rsmeD: de foutenschatting voor het domeinmodel

• H_VL_finaal: een geschatte hoogte voor de omtrekklasse volgens het Vlaams model waarvan het domeinmodel afgeleid is

• rmseVL: de foutenschatting voor dit Vlaams model

• HogeRmse: TRUE als het domeinmodel een hoge RMSE heeft, anders NA

inbo/dhcurve documentation built on April 6, 2023, 5:17 a.m.