R/nkbc-onk-stralbeh-efter-mastektomi-29.R

In oc1lojo/nkbcind: Verktyg för kvalitetsindikatorer och populationskarakteristik från NKBC

#' @export
nkbc29 <- list(
  code = "nkbc29",
  kortnamn = "nkbc_onk_stralbeh_efter_mastektomi_29",
  lab = c(
    sv = "Strålbehandling efter mastektomi",
    en = "Radiotherapy after mastectomy"
  ),
  pop = c(
    sv = "invasiva fall med spridning till lymfkörtlarna (fall med enbart mikrometastas exkluderade) och utan fjärrmetastaser vid diagnos, opererade med mastektomi",
    en = "invasive cases  with lymph node metastase (cases with only micrometastasis excluded) and without distant metastasis at diagnosis, operated with mastectomy"
  ),
  pop_short = c(
    sv = "invasiva fall med mastektomi, spridning till lymfkörtlarna och utan fjärrmetastaser vid diagnos",
    en = "invasive cases with mastectomy with lymph node metastasis and without distant metastasis at diagnosis"
  ),
  filter_pop = function(x, ...) {
    dplyr::filter(
      x,
      # Inrapporteringen av given onkologisk behandling har påbörjats vid olika tidpunkter i olika sjukvårdsregioner.
      # Fr.o.m. 2012 anses rapportering ha skett nationellt
      lubridate::year(a_diag_dat) >= 2012,

      # Enbart fall med invasiv cancer
      d_invasiv_Varde == 1,

      # Enbart fall med mastektomi eller subkutan mastektomi
      op_kir_brost_Varde %in% c(2, 4),

      # Enbart fall med spridning till lymfkörtlar,
      # preoperativt verifierad lymfkörtelmetastas och/eller
      # lymfkörtlar med metastas (ej fall med enbart mikrometastas) från något axillingrepp (oavsett primär behandling)
      (
        a_pad_snmet_Varde %in% 1 |
          (
            op_pad_lglmetant > 0 &
              !((op_pad_snmakrometant == 0 & op_pad_snmikrometant > 0 & op_pad_lglmetant == op_pad_snmikrometant) %in% TRUE)
          )
      ),

      # Ej fall med fjärrmetastaser vid diagnos
      !(a_tnm_mklass_Varde %in% 10)
    )
  },
  mutate_outcome = function(x, ...) {
    dplyr::mutate(x,
      outcome = as.logical(post_rt_Varde)
    )
  },
  target_values = c(70, 85),
  period_dat_var = "a_diag_dat",
  sjhkod_var = "post_inr_sjhkod",
  other_vars = "a_pat_alder",
  om_indikatorn = list(
    sv = paste(
      "Då hela bröstet opereras bort (mastektomi) behövs ofta inte strålbehandling.",
      "Vid spridning till lymfkörtlarna (makrometastas) bör dock strålbehandling ges både mot bröstkorgsvägg och lymfkörtlar."
    ),
    en = paste(
      "After mastectomy radiotherapy is indicated in case of axillary lymph node involvement (macrometastasis).",
      "Radiotherapy is then directed to both chest wall and regional lymph nodes."
    )
  ),
  vid_tolkning = list(
    sv =
      "Spridning till lymfkörtlar definieras som preoperativt verifierad lymfkörtelmetastas och/eller metastas >0.2 mm i axillen vid axillkirurgi (oavsett primär behandling).",
    en =
      "Lymph node metastasis is defined as preoperatively verified lymph node metastasis and/or metastasis >0.2 mm in the axilla at axillary surgery (regardless of primary treatment)."
  ),
  inkl_beskr_onk_beh = TRUE,
  teknisk_beskrivning = NULL
)
class(nkbc29) <- c("keynkbcind", "nkbcind")