R/AllClasses.R

In pkimes/spliceclust: Visualization and Clustering of Spliced Components

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## construct union class to allow for empty eCoverage jCoverage slots

setOldClass("matrix")
setClassUnion("MatrixOrNULL", c("matrix", "NULL"))


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## main connected component class

#' @name concomp-class
setClass("concomp",
         slots=list(
             eRanges = "GRanges",
             jRanges = "GRanges",
             eCoverage = "MatrixOrNULL",
             jCoverage = "MatrixOrNULL"))