Especes_Typiques: Especes_Typiques

In RenaudJau/Renaudpack2: Un fourre tout de mes fonctions...

Especes_Typiques

Description

Especes_Typiques

Usage

Especes_Typiques(
  RELEVES,
  FAC,
  MOD = "All",
  NOMBRE,
  NOMBRESTRICT = FALSE,
  METRIQUE = "Frequence"
)

Arguments

RELEVES	le tableau de relevés
FAC	vecteur du facteur donnant les catégories
MOD	modalité du facteur FAC à afficher, si rien n'est mentionné, réalisé pour chaque modalité
NOMBRE	nombre d'espèces les plus abondantes à afficher (possibilité d'avoir plus d'espèces affichées si ex aequo sauf si NOMBRESTRICT = TRUE)
NOMBRESTRICT	affichage ou non des ex aequo
METRIQUE	métrique utilisée pour le classement. Par défaut c'est la fréquence, i.e. le pourcentage de relevés dans laquelle l'espèce est présente. Sinon c'est l'abondance moyenne à l'échelle de l'ensemble des relevés de la modalité (pas uniquement ceux où l'espèce est présente).

Examples

library(vegan)
data("dune")
data("dune.env")
Especes_Typiques(RELEVES = dune, FAC = dune.env$Use, NOMBRE = 5)
Hay <- Especes_Typiques(RELEVES = dune, FAC = dune.env$Use, NOMBRE = 3,
                 MOD = "Hayfield", NOMBRESTRICT = TRUE)
Hay

RenaudJau/Renaudpack2 documentation built on Feb. 16, 2025, 7:33 p.m.