multivar.polyg: multivar.polyg

In RenaudJau/Renaudpack2: Un fourre tout de mes fonctions...

Description

Dessine des polygones autour des points en fonction des modalites d'un facteur

Usage

multivar.polyg(
  ANAcoo,
  FAC,
  pch = 1,
  col_dot = 1,
  col_fill = NA,
  col_text = 1,
  col_bord = 1,
  cex_lab = 1,
  font_lab = 1,
  dot = "yes",
  lab = "yes",
  new = "yes",
  sep = "no",
  ...
)

Arguments

ANAcoo	coordonnees des points d'une analyse multivariees (__$points pour une NMDS, __$li pour une AFC, etc.)
FAC	facteur qui permettra de separer les polygones
pch	symbole des points (noir par defaut)
col_dot	couleur des points (noir par defaut)
col_fill	couleur du remplissage des polygone (transparent par defaut)
col_text	couleur du texte (noir par defaut)
col_bord	couleur des lignes du polygone (noir par defaut)
cex_lab	taille des noms de modalites (si lab="yes")
font_lab	police des étiquettes
dot	si dot="yes", trace les points de chaque individu, "yes" par defaut
lab	si lab="yes", affiche le nom de la modalite au niveau du barycentre de ses points, "yes" par defaut
new	si new="yes", trace les polygones sur une nouvelle fenetre (defaut), sinon, sur le graphe existant
sep	si sep="yes", trace chaque polygone sur une fenetre graphique differente, "no" par defaut
...	possibilite de rajouter des arguments comme main,ylab,etc. associees a plot

Examples

library(vegan)
data(varespec)
data(varechem)
facteur_Alu<-factor(ifelse(varechem$Al<50,"Al50",
                           ifelse(varechem$Al<110,"Al110",
                                  ifelse(varechem$Al<230,"Al230","Al++"))))
ord <- metaMDS(varespec)
multivar.polyg(ord$points,facteur_Alu)

RenaudJau/Renaudpack2 documentation built on Dec. 12, 2020, 5:14 a.m.