label.corNMDS: Affichage d'especes correlees

In RenaudJau/Renaudpack2: Un fourre tout de mes fonctions...

Description

Calcul les correlations des especes avec les axes puis n'affiche que les plus correlees

Usage

label.corNMDS(ANALYSE, RELEVES, p1 = 0.05, p2 = 0.05, coef = 1, add = F)

Arguments

ANALYSE	Objet resultant d'une analyse multivariee dudi.pca, dudi.coa, metaMDS ou decorana
RELEVES	les releves ayant servi a faire l'analyse multivariee
p1	a p value minimale de correlation avec l'axe 1 pour etre affichee
p2	la p value minimale de correlation avec l'axe 2 pour etre affichee
coef	un coef multiplicateur (pour exploser ou non la dispersion dans le plan)
add	par defaut, creer un graphe seul, si add=T, les noms d'especes sont ajoute au graphe deja existant

Details

Attention, des erreurs souvent lorsqu'il y a des especes avec 0 occurences!!!! (hein Julie!)

See Also

label.cor apres dudi.pca ou dudi.coa ; label.corNMDS apres une NMDS avec metaMDS ; label.corDCA apres une DCA avec decorana

RenaudJau/Renaudpack2 documentation built on Dec. 12, 2020, 5:14 a.m.