tests/testthat/test_CreateBirdsEyeView.R

test_that("CreateBirdsEyeView runs without failure", {
test.sequences <- structure(c("a", "a", "a", "a", "a", "a", "a", "c", "a", "a", 
"g", "g", "c", "a", "a", "c", "c", "g", "c", "c", "t", "c", "g", 
"c", "c", "n", "t", "t", "c", "c", "g", "t", "t", "t", "t", "g", 
"g", "g", "t", "t", "g", "g", "g", "g", "g", "c", "c", "c", "c", 
"c", "a", "a", "c", "c", "c", "t", "g", "g", "g", "g", "t", "t", 
"t", "t", "g", "t", "g", "t", "t", "t", "c", "c", "c", "a", "a", 
"a", "a", "a", "c", "c", "g", "g", "g", "g", "g", "g", "g", "g", 
"c", "c", "g", "g", "g", "t", "t", "t", "t", "t", "t", "t", "g", 
"g", "a", "a", "a", "a", "a", "c", "a", "a", "g", "g", "a", "a", 
"a", "c", "c", "g", "c", "c", "c", "c", "g", "c", "c", "c", "g", 
"t", "g", "a", "g", "t", "t", "a", "t", "g", "g", "g", "g", "t", 
"g", "g", "g", "g", "g", "c", "c", "c", "c", "c", "a", "c", "c", 
"c", "c", "a", "g", "g", "g", "g", "t", "g", "t", "g", "g", "a", 
"g", "t", "g", "t", "c", "c", "c", "a", "a", "a", "a", "a", "c", 
"c", "g", "c", "g", "a", "g", "g", "g", "g", "c", "c", "g", "g", 
"g", "t", "t", "t", "t", "t", "c", "t", "a", "a", "a", "a", "a", 
"t", "t", "a", "t", "a"), .Dim = c(5L, 42L), .Dimnames = list(
    c("Turkey    ", "Salmo gair", "H. Sapiens", "Chimp     ", 
    "Gorilla   "), c("1", "2", "3", "4", "5", "6", "7", "8", 
    "9", "10", "11", "12", "13", "14", "15", "16", "17", "18", 
    "19", "20", "21", "22", "23", "24", "25", "26", "27", "28", 
    "29", "30", "31", "32", "33", "34", "35", "36", "37", "38", 
    "39", "40", "41", "42")))
   expect_that(CreateBirdsEyeView(test.sequences), not(throws_error()))
})
bomeara/sleq documentation built on May 12, 2019, 11:36 p.m.