cargar.out_all: Una función para leer y combinar todos los archivos "out".

In gerbeldo/tidycell: CellID Data Analysis Inside the Tidyverse

Una función para leer y combinar todos los archivos "out".

Description

Una función para leer y combinar todos los archivos "out".

Usage

cargar.out_all(
  path,
  position.pattern = ".*Position(\\d+).*",
  out_file_pattern = "^out_all$",
  out_mapping_pattern = "^out_bf_fl_mapping$",
  fluorescence.pattern = ".*([A-Z])FP_Position.*"
)

Arguments

path	path a la carpeta donde están os output de CellID
position.pattern	Regex describing what the position string looks like (default 'Position\d+')
fluorescence.pattern	Regex describing what the fluorescence string looks like (default ".*([GCYRT])FP_Position.*")
.nombre.archivos	paths de los "out_all"
.nombre.archivos.map	paths de los "bf_fl_mapping"

Value

A list of two dataframes: 'd' contains the actual output, and 'out.map' contains image paths and metadata.

gerbeldo/tidycell documentation built on Aug. 15, 2022, 2:35 p.m.