Cluster | R Documentation |
Realiza analysis de cluster hierarquico e nao hierarquico em um conjunto de dados.
Cluster(data, titles = NA, hierarquic = TRUE, analysis = "Obs",
cor.abs = FALSE, normalize = FALSE, distance = "euclidean",
method = "complete", horizontal = FALSE, num.groups = 0,
lambda = 2, savptc = FALSE, width = 3236, height = 2000,
res = 300, casc = TRUE)
data |
Dados a serem analizados. |
titles |
Titulos para os graficos, se nao for definido assume texto padrao. |
hierarquic |
Agrupamentos hierarquicos (default = TRUE), para agrupamentos nao hierarquicos (method K-Means), somente para caso 'analysis' = "Obs". |
analysis |
"Obs" para analises nas observacoes (default), "Var" para analises nas variaveis. |
cor.abs |
Matriz de correlacao absoluta caso 'analysis' = "Var" (default = FALSE). |
normalize |
Normaliza os dados somente para caso 'analysis' = "Obs" (default = FALSE). |
distance |
Metrica das distancias caso agrupamentos hierarquicos: "euclidean" (default), "maximum", "manhattan", "canberra", "binary" ou "minkowski". Caso analysis = "Var" a metrica sera a matriz de correlacao, conforme cor.abs. |
method |
Metodo para analises caso agrupamentos hierarquicos: "complete" (default), "ward.D", "ward.D2", "single", "average", "mcquitty", "median" ou "centroid". |
horizontal |
Dendrograma na horizontal (default = FALSE). |
num.groups |
Numero de grupos a formar. |
lambda |
Valor usado na distancia de minkowski. |
savptc |
Salva as imagens dos graficos em arquivos (default = FALSE). |
width |
Largura do grafico quanto savptc = TRUE (defaul = 3236). |
height |
Altura do grafico quanto savptc = TRUE (default = 2000). |
res |
Resolucao nominal em ppi do grafico quanto savptc = TRUE (default = 300). |
casc |
Efeito cascata na apresentacao dos graficos (default = TRUE). |
Varios graficos.
tab.res |
Tabela com as similaridades e distancias dos grupos formados. |
groups |
Dados originais com os grupos formados. |
res.groups |
Resultados dos grupos formados. |
R.sqt |
Resultado do R quadrado. |
sum.sqt |
Soma do quadrado total. |
mtx.dist |
Matriz das distancias. |
Paulo Cesar Ossani
Marcelo Angelo Cirillo
Mingoti, S. A. Analysis de dados atraves de metodos de estatistica multivariada: uma abordagem aplicada. Belo Horizonte: UFMG, 2005. 297 p.
Ferreira, D. F. Estatistica Multivariada. 2a ed. revisada e ampliada. Lavras: Editora UFLA, 2011. 676 p.
Rencher, A. C. Methods of multivariate analysis. 2th. ed. New York: J.Wiley, 2002. 708 p.
data(DataQuan) # conjunto de dados quantitativos
data <- DataQuan[,2:8]
rownames(data) <- DataQuan[1:nrow(DataQuan),1]
res <- Cluster(data, titles = NA, hierarquic = TRUE, analysis = "Obs",
cor.abs = FALSE, normalize = FALSE, distance = "euclidean",
method = "ward.D", horizontal = FALSE, num.groups = 2,
savptc = FALSE, width = 3236, height = 2000, res = 300,
casc = FALSE)
print("R quadrado:"); res$R.sqt
# print("Soma do quadrado total:"); res$sum.sqt
print("Grupos formados:"); res$groups
# print("Tabela com as similaridades e distancias:"); res$tab.res
# print("Tabela com os resultados dos grupos:"); res$res.groups
# print("Matriz de distancias:"); res$mtx.dist
write.table(file=file.path(tempdir(),"SimilarityTable.csv"), res$tab.res, sep=";",
dec=",",row.names = FALSE)
write.table(file=file.path(tempdir(),"GroupData.csv"), res$groups, sep=";",
dec=",",row.names = TRUE)
write.table(file=file.path(tempdir(),"GroupResults.csv"), res$res.groups, sep=";",
dec=",",row.names = TRUE)
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